一是仓储物流物流相关设施及研究缺乏。由于农村道路状况较差，各种运输与仓储设备，以及加工与保鲜技术都相对落后，导致了仓储物流物流损耗普遍偏高，不仅运作效率低下，而且运输成本还很高。由于涉及仓储物流仓储、运输、通讯和装卸等环节的基础设施相对比较落后，严重制约了仓储物流物流的发展。另外，我国仓储物流物流研究成果也相对贫乏，需要进一步完善和系统化，尤其是缺少仓储物流物流发展中操作层面及关键问题的深入细致的研究。
二是物流信息化建设滞后。物流信息建设是仓储物流物流健康发展的主要动力之源。目前，我国仓储物流数量较大、品种众多、质量不等，没有形成专业化的种植基地；我国物流信息化程度相对低下，而产品是有其交货时限和生命周期的，使得产品周转的时间过长，极大地降低了仓储物流的实际价值，也影响了市场供求信息。另外，生产者的分散经营是导致仓储物流生产和运输难以形成规模优势的一大障碍。彼此之间的条块分割严重，信息共享率低，仓储物流之间的供求信息不能相互弥补，难以形成整体优势，导致了重复种植、重复运输等资源浪费现象严重。同时，仓储物流信息网络也是种植户和大型农业集团了解市场信息，以信息指导种植经营的渠道之一。而我国目前正是缺少这样一个专业化的信息平台，由于平台经营的效率不高，从而也就难以提供有效的信息服务。三是仓储环境不容乐观。仓储物流储存需要较好的仓储环境和设施，因为仓储物流对人们来说是很重要的生活资料。仓储物流生产受自然条件制约大，各地因气候、土壤、降水等情况的不同，在仓储物流种植上适宜不同的品种。如果某一地区不顾自然条件，盲目种植，其产量和质量均比适宜地区低得多。这样的仓储物流会因为销售困难而难以进入流通渠道，可能较长时间地储存于仓库，对仓储物流物流的通畅形成障碍。但是，目前的仓储物流仓储条件很难满足这一要求，在很多地方缺乏相关的冷藏技术、安全防范，以及进出库管理等规范标准，仅有基础库房设施。
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