建筑企业办理资质会经过相关部门的审批，有的资质只需要住建部门审批就可以办理，但是有的建筑资质需要经过多个部门的审批才能领取资质证书。新疆资质代办的专业人员表示根据相关的建筑资质管理条例，建筑业企业资质由各级住房和城乡建设主管部门监督管理，但道路、水运、水利、通信、铁路、民用航空和其他资质由各级人民政府和住建部共同配合审批。因此，如果企业申请专业资质相关的公路、水运、水利、通信、铁路、民航工程资质等，当提交建筑业企业资质申请表时，专业的涉及方面必须加建筑业企业资质申请表一套、附件材料一套，除了提交申请到相应的住房和城市建设部门外，还需要提交相关专业的有关部门审批部门，就是所谓的多部门审批。
需要多部门批准的建筑企业资质主要包括：
1、公路相关资质：公路工程施工总承包资质、公路路面工程专业承包资质、公路路基工程专业承包资质、公路交通工程承包资质。
2、水运相关资质：港口航道工程总承包资质、港口与海岸工程专业承包资质、航道工程专业承包资质、通航建筑物工程专业承包资质、港航设备安装及水上交管工程工程专业承包资质。
3、水利相关资质：水利水电工程总承包资质、水利水电安装工程专业承包资质、水工金属结构制作与安装工程专业承包资质以及河湖整治工程工程专业承包资质。
4、通信资质：通信工程施工总承包资质。
5、铁路相关资质：铁路工程总承包资质、铁路电气工程专业承包资质、铁路铺轨架梁工程专业承包资质、铁路电气化工程承包专业资质。
6、民航相关资质：机场场道工程专业承包资质、民航空管工程及机场弱电系统工程专业承包资质、机场目视助航工程专业承包资质。
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