水面垃圾打捞船长期在水中运行，许多水域水质受到污染，对船体的腐蚀不可小视，做好日常维护保养工作是必要的，船体一旦被腐蚀,就会影响船舶钢结构的强度,从而影响了船舶的使用寿命,使航行速度大大降低,不仅影响了船舶的使用性能和寿命,也加大了航行中的危险程度，而且做好日常维护也可降低维修频率，避免影响日常的水面保洁工作。
平时也要注意船只的情况，定期进行防腐油漆和运动部件润滑工作。上油漆前要先清理船体，清除船只表面的铁锈、氧化皮、油污等。每年都要进行一次的检查，更换腐蚀的零件，检查柴油机的工作情况。如果船只要停用一段时间，应将船只拉上岸，检查各部分无生锈损坏，进行维护上漆，并封存。
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