装配式移动厕所都是在户外环境中使用，由于内部必须要安装下水管道，到了冬季，厕所内部的保温就是一个很实际的问题，保温性能差的话，下水管道很容易上冻，影响使用，甚至会发生管道冻裂的情况，所以在北方，装配式移动厕所需要很好的保温性能，厕所内部的环境温度要大于0度，另一点就是保温性能，在炎热的夏季也能起到隔绝外部高温的作用。
首先装配式移动厕所的保温，要使用保温材料，墙体要有一定的厚度，这也是装配式移动厕所外墙大多使用金属雕花板的原因，金属雕花板是由外表面的彩涂金属压花板和防火板、保温绝热材料复合而成、中间有一层保温棉，可有效隔绝室外冷空气。
还有一点就是在装配式移动厕所的所有管道上均可做外保温处理，保温层厚度不低于50mm厚，安装电伴热保温系统，管道电伴热保温系统由：发热电缆、电源系统、保温材料等组成，将发热电缆缠绕在管道上，工作状况下，温度传感器安置在被加热的管道上，可随时测量出其温度，通过伴热电缆，以达到加热防冻目的。