当北虫草菌种接好后，移入22-24℃恒温培养室，摇床震荡发菌培养。摇床转速140r/min，经过4-6天的发菌培养，经检查北虫草菌液的颜色开始清亮、菌球密集，瓶口闻有很浓的北虫草气味，可判断为菌种优良。如发现发菌瓶内浓度低、气味臭，并有五颜六色的菌液，就是有杂菌污染，坚决不能用。北虫草
制作二级摇瓶：培养基同一级，用5000ml三角瓶装量2000ml北虫草液体菌种，灭菌冷却后把一级摇瓶种按10%无菌操作接入大摇瓶，22-24℃，140r/min震荡培养72小时后，菌球大小均匀、密度80%以上，菌液清亮，气味清香、无污染的即为合格菌种。由于5000ml大摇瓶体积较大，用手提高压锅放不下，用大锅又太浪费，为解决大摇瓶灭菌问题，花山食用菌研究所研制了一款100升立式电加热自控高压灭菌锅，一次可灭4个5000的大摇瓶，同时，研制了一次可摇5-7瓶5000ml大三角瓶的摇床，轻便、无噪音、耗能低。
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