（一）阳光消毒 阳光消毒是最廉价最环保的方法，主要是利用夏季的高温借助阳光杀死病虫害。消毒时，先消除前茬病株残体并彻底清洁温室大棚，再对土壤进行深翻，随后灌大水，然后用聚乙烯塑料薄膜全面覆盖棚内土壤，再在太阳下密闭暴晒15－25天，使10厘米土壤内土温高达50－60℃以上，可有效预防枯萎病、青枯病、软腐病等上传病害，同时高温也能杀死线虫及其他虫卵。
（三）药剂消毒药剂消毒的步骤是：一、清洁棚室，在上茬结束后，将所有植株残体清出温室大棚，深埋或焚烧；二、深翻土壤，在土壤墒情适合时深翻，深度约30厘米以上，并将大土块拍打细碎；三、用药，药剂喷洒在土壤上后，用塑料薄膜覆盖1－2个星期。
（四）热水消毒 此法是利用锅炉等设备把水加热至75℃以上，然后将热水浇灌到土壤中，使土温升高来进行消毒。消毒前应该多施些有机肥，后深翻土壤，并把土壤整平，接着在地面上铺设滴灌管，用质量较好的塑料薄膜封严地面，之后通入热水。给水量因土质、外界温度、栽培作物的种类不同而不同。这种方法还有不受季节影响、可随时可对温室大棚进行消毒的好处
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