相对于榨汁，当然是直接吃水果好啊，因为直接吃水果是吃下了水果原有的所有的营养元素，维生素含量是最完整的，对于健康也是非常有好处的，吸油刮脂的效果也是比较出色的。榨汁会导致很多营养素的流失，并且相比较直接进食水果，水果榨汁也存在四大缺点：
第一，鲜榨果蔬汁不能长期保存。一方面，水果蔬菜在打汁时，细胞结构被破坏，各种抗氧化成分和维生素C被暴露出来。当遇到氧气或者水果蔬菜本身的一些酶时，这些营养素就会被破坏。而且存放的时间越长，维生素和抗氧化成分的损失就越多。此外，由于自己制作果蔬汁时很难灭菌，所以微生物在果蔬汁中生长繁殖是不可避免的，所以从安全的角度讲，鲜榨果蔬汁也不宜存放过久。
第二，鲜榨果蔬汁饮用不如喝包装好的饮料方便。毕竟要自己动手清洗原料、榨汁机，不如现成的果汁来的方便。不过要想获得健康，就不要介意多花点功夫了!
第三，鲜榨果蔬汁容易褐变。这是因为许多果蔬中含有多酚类物质和酚氧化酶。平时，这两类物质被分隔在细胞的不同区域中，彼此难以“见面”，所以相安无事不会发生反应。榨汁时破坏了细胞，这两类物质相遇，再加上空气中充足的氧气，酚氧化酶很快会催化无色的多酚类物质发生氧化反应，生成有色的醌类物质。这些醌类物质能够相互聚合，使颜色越来越深。开始时为粉红色，然后变成浅褐色、褐色以至黑色。切马铃薯、甘薯、茄子、苹果等水果蔬菜切开后会变黑，全都是源于这一个道理。
而市场上卖的果汁、蔬菜汁和冷冻薯条之类的产品之所以不是褐色的，这是因为在这些产品的加工中采取了一些特殊的保护措施，办法无非有几种：一是先将食物在沸水中短暂热烫，让酚氧化酶失活，不能再催化氧化反应。二是在榨汁时添加少量亚硫酸盐、柠檬酸、维生素C等无害物质，它们有的能够抑制酚氧化酶的活性，有的能够与促进氧化的金属离子结合，有的能够把氧化后的有色物质还原成无色物质。三是经过吸附作用，除去部分褐色物质。经过几方面的努力，产品就基本上可以保持漂亮的颜色。不过尽管褐变的果汁很难看，但引起褐变的物质却都是一些抗氧化的健康成分。所以说，不要因为颜色改变而歧视这些水果蔬菜。
当然，如果能选择那些不容易褐变的水果蔬菜来榨汁是最简单的办法。这些原料包括柑橘、草莓、番茄、胡萝卜、芒果、西瓜等，其实它们也会褐变，只是速度不会像苹果等那么快。
第四，鲜榨果蔬汁的营养价值不如水果蔬菜。尽管鲜榨果蔬汁比市售的果汁、果汁饮料更健康更营养，但是仍有一部分营养素受到了破坏，所以不如吃完整的水果蔬菜。甚至很多人原本有每天吃水果的习惯，结果现在赶时髦，买了榨汁机，用喝鲜榨果蔬汁代替了吃水果，其实这种做法并不可取，鲜榨汁本身并不带来营养价值的改善，甚至还有明显的损失。
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